Как можно оптимизировать существующую таблицу, в частности с помощью ReplacingMergeTree, если актуально хранение большого объёма данных?

ReplacingMergeTree полезен для хранения версий с последующим выбором актуальной строки, но не является универсальным способом ускорить большую таблицу.

Дубликаты определяются ключом ORDER BY, а версия помогает выбрать победителя. Фоновое слияние не гарантирует немедленную дедупликацию; запрос должен учитывать актуальность, например через FINAL или подходящую агрегацию.

Сначала проверьте ключи, партиции, объём чтения и число частей. Не меняйте движок без модели обновлений и проверки стоимости запросов: история и дубликаты могут оставаться до слияния.

Источник: clickhouse.com.