Как организовать обновление доработанной конфигурации, если изменения сделаны не только расширениями, но и в основной конфигурации?

Обновление доработанной конфигурации выполняют на копии базы: сравнивают изменения поставщика и свои доработки, объединяют их и проверяют совместную работу.

Подготовьте резервную копию, исходную версию поставщика и перечень изменений. Конфликты нужно разрешать по смыслу, а не механически выбирать одну сторону. После объединения проверьте обработчики обновления, расширения, обмены и ключевые расчёты. Выпуск в рабочую базу планируют только после проверки и подготовки возврата.