Можно ли безболезненно разделить здравпункт МНВБГ и Белую гору для раздельного просмотра статистики, и что для этого потребуется?

Раздельная статистика возможна, если записи можно надёжно отнести к каждому здравпункту. Без схемы данных нельзя обещать, что разделение будет безболезненным.

Проверьте, существует ли стабильный идентификатор подразделения в первичных событиях, как связаны справочники и можно ли восстановить принадлежность исторических записей. Затем уточните правила фильтрации, доступы и пересчёт отчётов. Если история уже агрегирована без нужного признака, точное разделение может потребовать исходных данных или оказаться невозможным; названия объектов сами этого не определяют.