Почему вы выбрали сочетание Helm и Kustomize, а не только Helm с дочерними чартами, и где проходит граница между ними?

Helm удобно параметризует и поставляет пакет, а Kustomize накладывает небольшие декларативные изменения на полученные ресурсы.

Комбинация оправдана, если отделяет владение chart от окруженческих overlays. Но два слоя усложняют диагностику: избегайте дублирования одних настроек и закрепляйте порядок рендера. Если хватает values и subcharts, дополнительный инструмент может не требоваться.